Chiapas culminó el 2021 con 751 quejas ante la Comisión Nacional de Derechos Humanos (CNDH), de acuerdo al cierre del Sistema Nacional de Alerta de Violación de los Derechos Humanos, ocupando el tercer lugar a nivel nacional, por debajo del Estado y la Ciudad de México; 44.07 % de las quejas ante la Comisión Nacional, fueron en contra del Instituto Nacional de Migración (INM) de la Secretaría de Gobernación.
Los hechos violatorios más concurrentes por parte de esta dependencia, fueron: la falta a la legalidad, honradez, lealtad y eficacia en el desempeño de las funciones; acciones y omisiones que transgreden los derechos migrantes; trato cruel, inhumano o degradante, y el uso excesivo de la fuerza.
Con el 20.23 % de las quejas acumuladas, el Órgano Administrativo Desconcentrado, Prevención y Readaptación Social, ocupó el segundo lugar de quejas en el estado. El hecho violatorio más recurrente de este organismo fue la negación de la atención médica, por medio de acciones y omisiones que transgreden los derechos de personas privadas de su libertad.
En el tercer puesto está la Comisión Nacional de Ayuda a Refugiados (Comar), la cual tuvo quejas violatorias por prestar indebidamente el servicio público, omitir la calidad de refugiado, dilación en los procesos administrativos y el uso de la fuerza pública; en total tuvo 81 quejas, representando el 10.78 %.
El instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS) acumuló un total de 48 quejas, por los actos violatorios de la prestación indebida del servicio, es decir, la omisión de proporcionar atención médica y tratos deficientes.
En el rubro de la salud, la negligencia médica fue el hecho violatorio con más presencia, con 388 quejas, de las cuales siete son de la entidad y en contra del IMSS.
A nivel nacional, las seis principales autoridades federales señaladas en los registros de quejas por el organismo público fueron: el Instituto Mexicano del Seguro Social, el Órgano Administrativo Desconcentrado, Prevención y Readaptación Social, el Instituto Nacional de Migración, Secretaría de Bienestar, Instituto de Seguridad y Servicios Sociales de los Trabajadores del Estado, y la Guardia Nacional.
