Actualmente dentro del Parque Nacional del Cañón del Sumidero no existen especies animales ajenas a este ecosistema, es decir, todas las que ahí habitan son endémicas de la región una situación que brinda una estabilidad ecológica dentro del sitio, a excepción de algunos gatos y perros que se han instalado en las inmediaciones de los miradores.
Cabe señalar, que constantemente la Comisión Nacional de Áreas Naturales Protegidas (Conanp) en Chiapas, realiza monitoreos en el lugar para verificar que ninguna especie ajena, tanto flora y fauna, ingrese al recinto natural lo cual podría provocar una alteración ambiental.
