En la recta final de las campañas, el Tribunal Electoral del Estado de Colima revocó la candidatura de Margarita Moreno González como abanderada de MC a la alcaldía de Colima, por no haberse deslindado a tiempo del PRI y buscar la reelección con otro partido.
El Tribunal otorgó un plazo de 24 horas al partido naranja para sustituir la candidatura de Moreno González, pero el instituto político decidió impugnar la resolución del Tribunal debido a que considera que esta se dio en medio de presiones políticas de parte del PRI y Morena.
En la elección de 2021 Moreno González llegó a la presidencia municipal de Colima como candidata del PRI y en esta elección busca repetir en el cargo por Movimiento Ciudadano; su candidatura fue avalada tanto por el Consejo Municipal Electoral como por el Consejo General del Instituto Estatal Electoral del Estado de Colima, sin embargo, su registro fue impugnado por el PRI y el PAN bajo el argumento de que no se desvinculó del tricolor antes de que transcurriera la primera mitad de su administración al frente de la capital del estado.
Con dos votos a favor y uno en contra, el Tribunal Electoral decidió que, en efecto, la emecista no se separó del tricolor a tiempo para poder ser postulada por otro partido a la reelección y otorgó un plazo de 24 horas a Movimiento Ciudadano para sustituir a su candidata.